В Республике Алтай 202 школы. Несмотря на то, что за последние 4 года введены в эксплуатацию 29 школ после завершения строительства и проведения капитального ремонта, в Республике Алтай остается много проблем по улучшению санитарно-технического состояния школ: 33 % школ не оборудованы водопроводом, 48% школ не канализованы, 61 % школ не имеют теплых туалетов. С целью улучшения санитарно-технического состояния школ в 11 муниципальных образованиях разработаны долгосрочные муниципальные целевые программы.
В 2009 г. Управлением Роспотребнадзора всем школам были выданы предписания и планы-задания по подготовке школ к новому 2010-2011 учебному году, всего 202 с общим количеством мероприятий на исполнение-1012. Выполнение этих предписаний позволит значительно улучшить санитарное состояние учебных заведений. В настоящее время на исполнение предписаний из Республиканского и муниципальных и бюджетов выделено 278960 тыс. рублей. 345 из 1012 мероприятий (34%) уже реализованы.
В 11 школах уже проводится водопровод, в 7 школах - канализации, в 20 школах оборудуются теплые туалеты, в 21 школах - медкабинеты. В 11 школах будет заменена мебель в 36 класс-комплектах, в 34 школах проводится замена технологического оборудования пищеблока. Проводится капитальный ремонт в 11 школах. К новому учебному году планируется сдать 3 школы: школа-интернат для детей-сирот №1, и школы в селах Сайдыс и Улус-Черга.
На сегодняшний день в 11 муниципальных образованиях работают штабы по подготовке школ, составлен график приема школ. Проведена предварительная проверка готовности в 78 образовательных учреждениях, в 68 установлено, что предписания выполнены. Отобрано 15 проб воды, нестандартных проб нет.
Учитывая то, что персонал образовательных учреждений проходит гигиеническое обучение с кратностью 1 раз в 2 года, в 2010г. в период подготовки школ было запланировано обучить 1162 человек, к началу августа уже обучены 365 из них.
Лечебно-профилактическими учреждениями составлен график прохождения медосмотров персоналом школ, 165 прошли медосмотры.
На рассмотрении в Управлении Роспотребнадзора по Республике Алтай находятся 72 расписания и цикличных меню, согласовано 2 меню.
Информация о ходе подготовки школ к новому учебному году рассмотрена 27.07.2010г. на уровне Главы Республики Алтай с приглашением глав муниципальных образований, 28.07.2010 на заседании у главного федерального инспектора в Республике Алтай.