В ходе праздничных мероприятий, во избежание возникновения случаев массовых инфекционных и неинфекционных заболеваний среди гостей и участников праздника, тремя бригадами сотрудников Роспотребнадзора осуществлялся контроль за соблюдением требований санитарного законодательства и законодательства о защите прав потребителей. Контролировалась работа 128 торговых точек, 3-х кафе и 21-ой точки общественного питания, своевременность мероприятий по уборке мусора, туалетов. В результате 5 должностных лиц, не имеющих медицинских книжек с отметками о здоровье продавцов, отстранены от работы на празднике. С реализации сняты 3 партии кулинарной продукции с истекшими сроками годности, удален с праздничных мероприятий продавец, реализовавший кулинарную продукцию с нарушением требований.
По итогам контроля Роспотребнадзором по Республике Алтай в адрес оргкомитета праздника, а также в адрес Правительства региона сформирован перечень предложений, реализация которых позволит в дальнейшем в ходе подобных мероприятий сохранить здоровье жителей и гостей региона, а также повысить уровень проводимых мероприятий.
Кроме контроля санэпидобстановки, сотрудники Роспотребнадзора приняли активное участие в соревнованиях праздника. Аржан Анатпаев постоянный участник команды города по поднятию гири. Виктор Мамрашев в составе команды Горно-Алтайска стал победителем командных соревнований по стрельбе из лука. Таким образом, в общекомандном третьем месте города Горно-Алтайска в соревнованиях Эл Ойына 2016 также есть вклад Роспотребнадзора по Республике Алтай.